Технология изготовления лекарств в аптеках ЛПУ нечем не отличается от аптек, обслуживающих население, поэтому штатные единицы в них те же, за некоторым исключением. Так, в аптеках в ЛПУ имеется должность провизора-клинициста, фармацевтического инспектора, заведующего газобаллонным хозяйством и инженера по ремонту техники. Отдельная комната для провизора-клинициста в аптеках ЛПУ не предусмотрена.
Аптеки ЛПУ, как и аптеки, обслуживающие население, имеются производственные, вспомогательные, административные и хозяйственно-бытовые помещения. Их размещают на первом этаже с соблюдением соответствующих санитарно-гигиенических требований. Эти помещения должны быть удобны для приема и хранения большого количества медицинского имущества, размещения средств механизации, аппаратуры и аптечной мебели. В аптеках ЛПУ нет торгового зала.
Важным санитарно-гигиеническим и противоэпидемическим требованиям является надежная изоляция помещений аптеки ЛПУ от лечебно-диагностических отделений, предназначенных для пребывания больных, но в то же время аптека должна иметь удобное, безопасное с точки зрения загрязнения и инфицирования сообщение с отделениями больницы.